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Neue Publikation in Microorganisms
Anton Lindig, Jenny Schwarz und Coautoren veröffentlichen die Publikation „Bivariate One Strain Many Compounds Designs Expand the Secondary Metabolite Production Space in Corallococcus coralloides” in MDPI/Microorganisms zur Etablierung einer multifaktoriellen OSMAC-Methode zur Entdeckung neuer Naturstoffe.
Naturstoffe aus Bakterien spielen eine wichtige Rolle in der Entwicklung von neuen Medikamenten, wie beispielsweise Antibiotika. Ein vielversprechender Vertreter von Bakterien als Produzent für neue bioaktive Naturstoffe ist das Myxobakterium Corallococcus coralloides. Genomanalysen haben gezeigt, dass C. coralloides noch viele unbekannte biosynthetische Gencluster für potenziell neue Naturstoffe besitzt. Jedoch bleibt der Großteil dieser biosynthetischen Gencluster unter Standard-Kultivierungsbedingungen im Labor inaktiv. Eine gezielte Aktivierung ist oft durch einfache Änderung der Kultivierungsbedingungen im „One Strain Many Compounds (OSMAC)“ beobachtbar. Im neu erschienen Artikel haben wir eine multifaktorielle OSMAC-Methode entwickelt und zur Entdeckung neuer Naturstoffe in C. coralloides angewendet. Im neuen bivariaten OSMAC-Ansatz werden zwei Kultivierungsbedingungen, z.B. die Änderung des Mediums, die Zugabe von Lösungsmitteln und/oder die Zugabe von biotischen Zusätzen, gleichzeitig verändert, um somit besser die komplexen Lebensbedingungen in einer natürlichen Umgebung im Labor nachstellen zu können und damit die Entdeckung neuer Naturstoffe zu ermöglichen. Anton Lindig, Jenny Schwarz und Coautoren konnten zeigen, dass mit dieser bivariaten OSMAC-Methode in der Zahl mehr und auch spezifischere Massen in Extrakten aus Kultivierungsansätzen nachgewiesen werden konnten. Die Etablierung dieser multifaktoriellen OSMAC-Methode wird die Entdeckung neuer und vielversprechenden Moleküle in C. coralloides und anderen Naturstoffproduzenten in Zukunft effizienter gestalten.